係以藝術史學為專業主體，並兼重文物修復與博物館學之基礎訓練，以培養兼具藝術史學、文物保存維護以及博物館蒐藏管理與展示能力之基礎人才為目標。為全國唯一以藝術作品之分析、品鑑與詮釋為核心，以整合藝術史學與博物館實務的一貫性系統訓練為發展方向之專業科系。為彰顯藝術史學之專業特性及其與文博實務之密切聯繫，本系無論在師資聘任、學生培育、課程設計與設施配置等面向，均朝向整合藝術史學、文物保存維護以及博物館實務三位一體之教學與發展目標進行規劃。
碩士班課程以本系大學階段養成為基礎，延伸藝術史與藝術評論、文化資產保護研究等領域之專業學習，進以深化東亞古今文物繪畫、西洋藝術、臺灣美術、近現代與當代藝術、視覺文化之專題研究，以及文物普查、鑑定、研究與分級等知能實踐。教學兼具理論扎根、專業實務訓練，與職場移地學習，以培養具備多元文化研究詮釋、科普轉化、與社會實踐能力之藝術史與藝術評論人才。
博士班課程旨在培養藝術史研究、文化資產保護實踐、具備藝術史觀之藝術評論與展覽策畫高階人才。課程訓練聚焦在養成學術專業知能的廣闊精深、累積系統性思辨批判與詮釋能力、強化規劃與執行獨立研究的實踐力、厚實能發微掘隱與開創視野的洞見力。在內容議題上含括中國大陸與臺灣傳世及考古出土文物、東亞及臺灣的佛教與書畫藝術、東亞近現代藝術、現當代藝術、西洋藝術（古典至現代）、文物藝術審美特質之評析、作品意涵之詮釋、人文精神與物質文化之解讀、臺灣美術系譜與檔案的研究、大眾文化與視覺理論、美學研究及藝評策展實踐等。
